تضمن قانون الموارد المائية والري الجديد ضوابط صارمة على التعامل مع المجاري المائية للحفاظ على المجاري المائية وري الشواطئ. على سبيل المثال ، نصت على تشكيل لجنة عليا للنظر في الطلبات المقدمة للحصول على تراخيص جديدة لأشغال أو إشغال داخل المنطقة المحظورة للشواطئ البحرية من ممثلي الجهات المختصة. واحد على الأقل من حملة الدرجة العالية ويصدر قرار من رئيس مجلس الوزراء بتشكيل اللجنة ونظام عملها وتحديد اختصاصاتها.
ترفع اللجنة توصياتها للوزير لاعتمادها ، وتكون موافقة الوزير على عمل اللجنة ملزمة للجهات الإدارية الأخرى ، وتلغى أي لجان تشكل في المحافظات وغيرها في هذا الشأن. تنظم اللائحة التنفيذية الإجراءات والشروط الواجب اتباعها.
كما نصت على أنه مع عدم الإخلال بأحكام القانون رقم 48 لسنة 1982 بشأن حماية نهر النيل والمجاري المائية من التلوث ، لا يجوز إلا بترخيص من الوزارة القيام بأي من الإجراءات الآتية:
الصرف في قناة عامة أو شبكة صرف مغطاة ، أو في منفذ تيار.
– الري بمياه الصرف الزراعي في حالة عدم توفر مصدر ري آخر.
– مرور ماكينة متحركة بأحمال ثقيلة على الجسور ومنشآت الري والصرف والمنشآت للحماية من مخاطر السيول التابعة للوزارة إذا كان ذلك من شأنه الإضرار بالجسور ومرافق الري والصرف والوقاية من أخطار السيول. .
بدون ترخيص من الوزارة وموافقة وزارة الصحة والسكان ، لا يجوز ري المحاصيل الزراعية بمياه الصرف الصحي المعالجة أو مياه الصرف الصناعي.